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最近は大方の人たちは、ウイルスが、どういうわけか染色体から自由に分かれて独立に増殖する方法を見つけ出した遺伝物質の宿無し断片である、と信じている。
「ジャンピング遺伝子」はこのような過程の始まりを示しているのかもしれない。 このような遺伝子は染色体のＤＮＡ鎖から脱け出して他の部位に再結合できるが、細胞からは脱出することができない。
これからさらに一歩進んだものがプラスミド染色体から離れて存在する遺伝粒子で増殖できるのである。 これらのＤＮＡの断片は、核の内部に生活する細菌のなかに見出されるが、その細菌の染色体とは無関係である。
彼らは宿主に対してときおり有害となる余計な遺伝子をもっている。 たとえば、プラスミドは、細菌が抗生物質に対する抵抗力をつけたり、有害な毒素を生産したりするための遺伝子を提供することがある。

プラスミドは自己の複製を完全に細胞に依存しているという点ではウイルスと同じであるが、彼らは粒子をつくらないのでウイルスとしては分類されない。 結果として、プラスミドは細胞の内部に閉じ込められたままであり、広がる能力はひどく限られている。
ほとんどの場合、彼らは細胞分裂の際に親細胞から娘細胞へ移動するだけであるが、ときには、二つの細菌が遺伝物質を交換するために一時的に結合する接合の際に、ある生物から他の生物へと直接に伝達されることがある。 プラスミドはウイルスの先祖かもしれないが、科学者のなかには、ウイルスの起源は自由生活する細胞からパラサイトヘと退化した細菌であると信じる人たちもいる。
このことが起こったとすれば、遠い過去のある時点で、彼らは必須栄養素を自分自身でつくるよりは他から盗むほうが容易なことを見つけ、ついに栄養素を生産する能力を完全に失って真正のパラサイトになってしまったに違いない。 しかしながら、このシナリオは可能性がないように見える。
なぜなら、退化したパラサイト細菌が現に存在しているが、彼らは明らかに細菌と類似しており、ウイルスからは、はっきり区別されるからである。 それゆえウイルスは、極端なまでに寄生を受け入れた現存の細菌の子孫か、あるいは自己を複製するための暗号を内蔵した単なる遺伝物質の断片かのどちらかであると考えられる。
このように、ウイルスが生きているのかどうかという疑問に対する答えは、見解と個人的な好みの問題のままにとどまっている。 感染症医学の専門家たちのほとんどは、遺伝的特性をもった病原体を生きていると考える。


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